苏州轨道交通有限公司成立于2002年5月。2007年5月，市委、市政府重组轨道公司。公司现有注册资本32.79亿元。经营范围为轨道交通工程建设、轨道交通运输服务、轨道交通项目投资与开发。
作为直属市政府领导的大型企业，轨道公司与苏州市轨道交通工程建设指挥部合署办公，现设7个职能处室和3家分公司。截止2011年底，公司共有员工1461人。
自2007年12月26日开工建设苏州轨道交通1号线以来，公司安全、优质、高效地推进1号线建设。2009年12月25日，开工建设了苏州轨道交通2号线。在四年的轨道交通工程建设中，公司积累了宝贵的经验，截止2011年底，1号线已顺利实现“洞通”、“轨通”、“电通”等重大节点目标，进入试运行阶段。2号线土建工程进度已超过八成。
公司始终坚持“民心工程、共建和谐”导向，以文明施工为管理主线，不断加强现场管理，尽可能减少施工影响，得到了广大市民的一致赞誉。自2007年起，苏州轨道交通工程连续五年被评为“苏州十大民心工程”。